Родился 22 января 1971 года в г. Сокаль Львовской области. В 1998 году окончил юридический факультет Львовского государственного университета им.И.Франко. Трудовую деятельность Магера начал учителем английского языка и физвоспитания Реклинецкой средней школы (Сокальский район). Затем работал на кирпичном заводе Сокальского управления кирпичных заводов. В 1997-1998 гг. был интерном-участником образовательной программы Помощник председателя Комитета Верховной Рады Украины. С 1998-го - помощник-консультант народных депутатов Украины.

С 2004 года уже трижды становился членом Центральной избирательной комиссии - в феврале 2004-го, декабре 2004-го и июне 2007-го. В последний раз, после инициированного Президентом Украины Виктором Ющенко роспуска Верховной Рады V созыва и объявления досрочных выборов, избран по квоте парламентской оппозиции в лице фракций Блока Юлии Тимошенко и Нашей Украины, получил должность зампредседателя ЦИК.

Имя Андрея Магеры стало известно широкой публике во время оранжевой революции, причиной которой стала массовая фальсификация результатов голосования на президентских выборах 2004 года. 24 ноября, через три дня после второго тура выборов, Центризбирком под руководством Сергея Кивалова принял постановление о признании провластного кандидата Виктора Януковича победителем гонки. Лишь трое членов ЦИК из 15 (в их числе - А.Магера) отказались подписать протокол о таких результатах выборов.