Анатолий Нестерук родился 16 ноября 1955 года в селе Семенов Белогорского района Хмельницкой области. В 1976 году окончил Хмельницкий электромеханический техникум, в 1984 году окончил Хмельницкий институт бытового обслуживания. С 1990 по 1998 года занимал пост первого заместителя председателя Исполкома Каменец-Подольской городской Рады. В апреле 1998 года был назначен директором Каменец-Подольского филиала ОАО Хмельницкгаз. С марта 2005 по август 2006 года работал первым заместителем председателя Хмельницкой областной государственной администрации. С 28 августа 2006 по июнь 2008 года - заместитель Хмельницкого городского головы. В июне 2008 года - избран мэром города Каменца-Подольского.

Бывшего мэра Каменец-Подольского оставили за решеткой Дунаевецкий городской суд отказал Каменец-Подольскому горсовету, который обратился с ходатайством об изменении меры пресечения для бывших городского головы Анатолия Нестерука и управляющего делами Николая Нечая. Судья объяснил отказ тяжестью совершенного преступления. На данное время у суда отсутствуют доказательства, которые свидетельствовали бы о том, что в ранее избранной мере пресечения взятия под стражу отпала необходимость. А поэтому, учитывая обстоятельства, тяжесть преступлений, в которых обвиняются подсудимые, и то, что находясь на свободе, они могут препятствовать установлению истины, суд приходит к выводу, что мера пресечения подсудимым - взятие под стражу - соответствует закону. Удовлетворению ходатайство не подлежит, - говорится в решении суда. Кроме того, судья приступил к государственному обвинению и начал зачитывать обвинительный приговор. Из 132 страниц пока прочитано лишь 15. Дунаевецкий горсуд 25 января отказал 27 общественным и религиозным организациям взять на поруки экс-мэра Каменец-Подольского Анатолия Нестерука. Мотивом для отказа изменить меру пресечения стало то, что бывший чиновник подозреваются в совершении тяжкого преступления. Бывший городской голова Каменец-Подольского Нестерук и экс-управляющий делами горисполкома Нечай обвиняются в вымогательстве у частного предпринимателя 300 тысяч гривен (110 из которых они получили) за предоставление в аренду 1,5 гектара земельного участка. Оба находятся под стражей с сентября прошлого года.

Женат. Жена - Нестерук Зоя Ивановна, 1959 года рождения. Сын - Нестерук Юрий, 1981 года рождения, дочь - Нестерук Елена, 1987 года рождения.